Im Rahmen der Erforschung neuer mariner Naturstoffe aus bisher unkultivierten Bakterien wurden über 90 verschiedenen Isolate aus dem deutschen Wattenmeer auf ihr Potential zur Sekundärstoffproduktion hin untersucht. Nach 16S rRNA Gen-Analyse gehörten 56 Stämme zur Gruppe der Gram positiven und 36 Stämme zur Roseobacter-Gruppe (alpha-Proteobacteria). Um die Probleme kultivierungsabhängiger Screening-Verfahren zu umgehen wurde ein molekularbiologisches, PCR-basiertes Verfahren angewendet, dass die Bakterien auf Gene der Polyketidsynthase, der FADH2-Halogenase und der nicht-ribosomalen Peptidsynthetase untersucht. Um die antagonistische Aktivität der Stämme zu erforschen wurden ergänzende Agar-Diffusionstest durchgeführt und ein Teil der Bakterien auf die Bildung von Acetyl-Homoserin-Lactonen (AHL) hin untersucht. Zusätzlich wurden insgesamt drei Isolate auf die Synthese von flüchtigen Sekundärmetaboliten gescreent, die entsprechenden Verbindungen isoliert und ihre Struktur aufgeklärt. <dt.>
Within the investigation of novel marine natural products from previously uncultered bacteria, over 90 isolates from the german Wadden Sea were screened for their potential for secondary metabolite production. 16 S rRNA gene analysis revealed, that 56 strains affiliated with Gram positive bacteria and 36 strains with the Roseobacter-clade (alpha-Proteobacteria). To avoid the problems of culture dependent screening procedures, a PCR-based approach was applied, in which bacteria were screened for polyketide synthase-, FADH2-halogenase- and non-ribosomal peptide synthetase genes. Additionally agar diffusion assays were applied to investigate the antagonistic activity of the strains, and some bacteria were tested for acylated homoserine lactones (AHL) production. Three isolates were additionally screened for synthesis of volatile metabolites, the corresponding compounds were isolated and their structure elucidated. <engl.>
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